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拟南芥数据库如何获取氨基酸序列

2、其次登录网国内对于青花菜基因表达的研究主要集中于雄性不育的相关基因方面。张国裕等（2006）对青花菜快速碱化因子RALF（Rapid Alkalinization Factors）基因进行了研究。他们以一个与甘蓝显性核不育相关的异表达片段序列为信息探针，在NCBI与TAIR网站数据库中进行同源EST序列搜索，经人工拼接、RT-PCR克隆与序列分析验证，获得了青花菜快速碱化因子RALF基因的cDNA全长序列，并命名为BoRALFL1（GenBank序列登录号DQ059310）。该cDNA全长240 bp，编码79个氨基酸，与电子克隆获得的序列完全相同。序列分析表明，编码蛋白存在前导信号肽与多个磷酸化位点，与同源基因RALFL8序列在88bp上有82%的一致性，推导的氨基酸序列在74个氨基酸上存在56%的一致性，不同植物间氨基酸序列N-端异大，C-端具有较高的保守性。研究表明，RALF是一类多肽激素，不同植物间序列的异可能暗示了它们是整个RALF多基因家族中的不同成员，进化过程中形成的功能专化性可能造成了成员间的序列异。然而，目前对RALF的试验研究还比较肤浅，据对拟南芥RALFL8的组织表达特异性的研究表明，它为花高丰度表达，BoRALFL1与RALFL8相似性很高，而且克隆探针来源于与核不育的基因相关。可以推测BoRALFL1与小孢子的发育有关，对BoRALFL1基因的克隆为进一步通过反义或技术研究其在小孢子发育中的具体功能，通过克隆其启动子调控序列融合GFP或GUS基因，研究其时空表达的特异性奠定了基础。站之后，选择Protein数据库，输入OVP1。

1、首先登录NCBI网站。

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应该是大写TAIRabbr. 机构典藏；拟南芥信息资源（The Arabidopsis Information ResourcNMBI网站。想找找拟南芥某个基因的cds序列的可以去NMBI网站中搜索，可得到相应的和蛋白质序列，信息很详细的。EMBL欧洲分子生物学实验室EMBL数序列数据库由欧洲生物信息学研究所EBI维护的序列数据构成，由于与GenBank和DDBJ的数据合作交换，也是一个全面的序列数据库。e）

怎么找拟南芥基因启动子序列

拟南芥T-DNA插入突变体拿到之后，我们需要先确定其插入位点相关信息。插入locus有时候未必是单一的，可能会插入一个基因的多个位置或Lee B. Smith等利用与拟南芥突变体相关的同源基因对青花菜再生、花的分生组织等进行了研究。认为特殊的等位基因BoCAL-a与花序形态的分离紧密相关，并认为对青花菜凝乳发育重要的两个位点进行PCR检测可用于标记选择。Nigel E. Gapper等（2005年）研究了6-BAP、ACC和蔗糖对青花菜采摘后快速衰老的作用，发现在外源6-BAP存在的情况下，在乙烯的生物合成过程中，与其相关的BoACO减少，而同时BoACS有所增加。采摘后在有外源6-BAP的情况下，BoCP5和BoMT1的量减少而BoCAB则保持稳定，另外编码蔗糖转运器的基因（BoSUC1和BoSUC2）以及编码碳水化合物代谢酶的基因（BoINV1和BoHK1）的表达量减少。结果表明，ACC对6-BAP诱导的BoACS表达的提高有抑制作用，而6-BAP对ACC诱导的 BoACO的表达的提高不起作用。的结果就是细胞分裂素在延迟衰老过程中起了重要的作用。细胞分裂素对青花菜采摘后衰老的调控是通过抑制乙烯作用或生物合成。这也为碳水化合物的转运和代谢以及衰老相关的基因的表达提供了一种思路和模型。者是插入多个基因，导致多基因突变。如果一开始没有明确其插入的确切位置，那么势必会导致后续实验出现问题，难以把握你所得到的表型时候是因为目的基因的突变导致的还是其他基因突变导致的。那么问题就来了，如何确定突变体插入位点信息？下面就从TAIR（拟南芥种质资源库）网站介绍开始，说明一下突变体信息的确定方法。

怎么找拟南芥某个基因的cds序列

另外，张国裕等（2006）还对青花菜雄性不育相关基因BoDHAR进行了相关的研究，同样以一个与甘蓝显性核不育相关的异表达片段的序列为信息探针，通过在NCBI与TAIR网站数据库中进行同源EST序列搜索，经人工拼接RT-PCR克隆与序列分析，获得了青花菜脱氢抗坏血酸还原酶DHAR（dehydro ascorbate reductase）基因的cDNA与DNA全长序列，命名为BoDHAR，并利用双链接头介导PCR的染色体步行技术（genomewalking）克隆了其上游644bp的5c端序列，所获的BoDHAR基因全长1486bp，存在两个内含子，DNA编码区序列633bp，编码210个氨基酸；序列分析表明：BoDHAR与同源基因AT1G1957011cDNA序列有82.13%的一致性，推导的氨基酸序列有79.16%的一致性；编码的水溶性蛋白存在多个磷酸化位点；5c端上游区存在明显的转录调控序列，半定量RT-PCR结果表明：BoDHAR在可育系花蕾中的表达量明显高于不育系晕 看到楼上的几个回答真生气啊 不懂在这瞎说花蕾，在花中的表达明显高于其他部位。对BoDHAR基因的克隆为进一步通过反义RNA或RNAi技术来研究其具体的功能，通过启动子序列融合GFP或GUS基因确定其表达的部位与时期及阐明其在雄性不育小孢子发育中的作用提供了依据。

如何进行青花菜的基因表达与克隆？

上TAIR 查找基因号或者基因名字空气温度，气温; 测试组件检查记录的意思 进入后进入sequence view 找到想要的基因 选择ATG上游2000bp左右的碱基 即是基因的启动子 如不懂加QQ414181542

拟南芥突变体信息查询

3、输入OVP1个体发育的过程实质是不同基因被激活或是被阻遏的过程。在发育的某个阶段，某些基因被激活而得到表达，另一些基因则被阻遏或保持阻遏的状态。对高等动植物，基因的表达与否可通过他的表达产物——蛋白质或转录产物mRNA来推测。以前对植物目的基因的克隆主要是通过已知基因产物的分析和鉴定，通过遗传表型分析或是以图谱为基础的定位克隆。国外对青花菜的分子生物学研究比国内要多，研究重点是与青花菜某些基因相关的信号传导，基因克隆等方面。之后，得到该基因的登录号为KC513744，就可以得到该基因的氨基酸序列。